Для точной ручной работы: Panamera и Panamera S серийно комплектуются 6-ступенчатой механической коробкой передач со спортивной настройкой. Она отличается оптимальным подбором передаточных чисел и точностью ходов рычага. Наклонная центральная консоль сокращает расстояние до рычага коробки передач. Это позволяет выполнять переключения в спортивном стиле. Для большего комфорта механизм переключения не имеет жесткой связи с коробкой передач. Преимущество: рычаг не вибрирует. Кроме того, двухмассовый маховик снижает шумность работы.
Индикатор моментов переключения на более высокие передачи, который находится на панели приборов, вносит свой вклад в снижение расхода топлива. Для обеих моделей можно заказать коробку передач Porsche Doppelkupplung (PDK).